Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms