Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms