Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms