Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms