Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNDC3BQ96NL0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms