Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms