Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms