Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRELD1Q96HD1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms