Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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FAM3DQ96BQ1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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