Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74AQ96AQ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74AQ96AQ1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms