Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E2Q96A05 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms