Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms