Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 DENND4A-205ENST00000562540 629 ntTSL 25.08□□□□□ -1.61e-7■■■■■ 33.2
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PUM2Q8TB72 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.221e-7■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.172e-10■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.876e-7■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.756e-7■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.656e-7■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.166e-7■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 ASAP2-204ENST00000484590 3869 ntTSL 27.72□□□□□ -1.176e-7■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.411e-12■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ERH-201ENST00000216520 668 ntTSL 312.87□□□□□ -0.352e-30■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.392e-30■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 SNCG-204ENST00000483064 794 ntTSL 213□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 SNCG-203ENST00000465679 641 ntTSL 211.93□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.562e-30■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ACLY-203ENST00000393896 3682 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.722e-30■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.272e-14■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.21e-10■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 11e-10■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.991e-10■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.121e-10■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ZC3H14-211ENST00000555755 2529 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.831e-10■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ZC3H14-203ENST00000318308 1384 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.211e-10■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.451e-10■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ZC3H14-208ENST00000554020 1193 ntTSL 55.88□□□□□ -1.471e-10■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.481e-10■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ZC3H14-216ENST00000556000 2092 ntTSL 1 (best)5.75□□□□□ -1.491e-10■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.491e-10■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.531e-10■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ZC3H14-212ENST00000555792 577 ntTSL 34.36□□□□□ -1.711e-10■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ARAP1-210ENST00000465814 5612 ntTSL 214.25□□□□□ -0.132e-9■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ARAP1-208ENST00000452383 994 ntTSL 313.58□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.292e-9■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.322e-9■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.352e-9■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 ARAP1-207ENST00000429686 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.862e-9■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-8■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 TMBIM4-214ENST00000633367 876 ntTSL 1 (best)12.08□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 TMBIM4-211ENST00000545504 409 ntTSL 310.56□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 TMBIM4-209ENST00000544599 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.822e-8■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 AC078927.1-201ENST00000539652 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.072e-8■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 TMBIM4-210ENST00000545407 1303 ntTSL 57.27□□□□□ -1.252e-8■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.282e-8■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.382e-8■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 TMBIM4-204ENST00000534930 571 ntTSL 56.06□□□□□ -1.442e-8■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.562e-8■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 MTOR-206ENST00000490931 1111 ntTSL 511.57□□□□□ -0.564e-12■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 MTOR-201ENST00000361445 8677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.934e-12■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 MTOR-204ENST00000473471 862 ntTSL 38.96□□□□□ -0.984e-12■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.454e-12■■■■■ 33.1
PUM2Q8TB72 RNF220-213ENST00000480686 3835 ntTSL 212.35□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 33.1
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PUM2Q8TB72 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.058e-7■■■■■ 33
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PUM2Q8TB72 KDM3A-205ENST00000441719 8741 ntTSL 210.35□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KDM3A-202ENST00000409064 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.472e-8■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.081e-11■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 MAP3K1-202ENST00000469188 3713 ntTSL 1 (best)2.69□□□□□ -1.981e-11■■■■■ 33
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PUM2Q8TB72 KIFC3-223ENST00000565684 623 ntTSL 520.74■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PTP4A1-203ENST00000473334 638 ntTSL 320.69■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 CHD4-214ENST00000545942 1317 ntTSL 1 (best)20.69■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KIFC3-227ENST00000566914 724 ntTSL 320.22■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 AFF1-206ENST00000507468 1486 ntTSL 1 (best)19.78■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 RRM2B-210ENST00000523957 603 ntTSL 519.73■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 EVI5-204ENST00000474806 525 ntTSL 319.27■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 RRM2B-208ENST00000522368 1613 ntTSL 219■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 CHD4-213ENST00000545584 553 ntTSL 418.09■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 POLR3E-205ENST00000563024 473 ntTSL 418.04■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 POLR3E-214ENST00000565358 565 ntTSL 418.04■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF326-204ENST00000394583 1956 ntTSL 1 (best)17.83■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 33
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