Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35BQ8NCS4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms