Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA4Q8IV77 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms