Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU89

CERS3, Ceramide synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS3Q8IU89 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CERS3Q8IU89 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CERS3Q8IU89 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CERS3Q8IU89 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CERS3Q8IU89 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CERS3Q8IU89 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CERS3Q8IU89 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CERS3Q8IU89 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CERS3Q8IU89 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CERS3Q8IU89 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CERS3Q8IU89 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms