Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF39Q86UA1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF39Q86UA1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms