Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFVQ71UI9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFVQ71UI9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFVQ71UI9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFVQ71UI9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFVQ71UI9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFVQ71UI9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFVQ71UI9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFVQ71UI9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFVQ71UI9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFVQ71UI9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFVQ71UI9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFVQ71UI9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFVQ71UI9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFVQ71UI9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms