Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms