Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms