Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms