Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms