Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CARMIL2Q6F5E8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms