Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms