Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL3Q4VX76 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms