Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms