Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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