Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms