Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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ZNF235Q14590 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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ZNF235Q14590 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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ZNF235Q14590 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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ZNF235Q14590 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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ZNF235Q14590 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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ZNF235Q14590 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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ZNF235Q14590 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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