Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD9Q14511 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
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