Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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