Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EBI3Q14213 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms