Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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