Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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