Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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ITGA9Q13797 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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ITGA9Q13797 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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ITGA9Q13797 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA9Q13797 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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