Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX3Q13761 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX3Q13761 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX3Q13761 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX3Q13761 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX3Q13761 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX3Q13761 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX3Q13761 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX3Q13761 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX3Q13761 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX3Q13761 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX3Q13761 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX3Q13761 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX3Q13761 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX3Q13761 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX3Q13761 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX3Q13761 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX3Q13761 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX3Q13761 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX3Q13761 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX3Q13761 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX3Q13761 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX3Q13761 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX3Q13761 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX3Q13761 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX3Q13761 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX3Q13761 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX3Q13761 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX3Q13761 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX3Q13761 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX3Q13761 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX3Q13761 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX3Q13761 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX3Q13761 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX3Q13761 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX3Q13761 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX3Q13761 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX3Q13761 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX3Q13761 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX3Q13761 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX3Q13761 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX3Q13761 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX3Q13761 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX3Q13761 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX3Q13761 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX3Q13761 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX3Q13761 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX3Q13761 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX3Q13761 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX3Q13761 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX3Q13761 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX3Q13761 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX3Q13761 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX3Q13761 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX3Q13761 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX3Q13761 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX3Q13761 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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