Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
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TMED1Q13445 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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TMED1Q13445 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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TMED1Q13445 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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