Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TRIR-203ENST00000589590 930 ntTSL 222.16■■□□□ 1.144e-7■■■■□ 26
PABPC4Q13310 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.321e-6■■■■□ 26
PABPC4Q13310 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.731e-7■■■■□ 26
PABPC4Q13310 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.621e-7■■■■□ 26
PABPC4Q13310 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.561e-7■■■■□ 26
PABPC4Q13310 MRPL37-203ENST00000398219 868 ntTSL 315.82■□□□□ 0.121e-7■■■■□ 26
PABPC4Q13310 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.631e-9■■■■□ 26
PABPC4Q13310 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.051e-9■■■■□ 26
PABPC4Q13310 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.262e-7■■■■□ 26
PABPC4Q13310 SCAMP3-208ENST00000490999 1011 ntTSL 218.99■□□□□ 0.638e-9■■■■□ 26
PABPC4Q13310 DNPH1-203ENST00000505042 396 ntTSL 215.67■□□□□ 0.13e-11■■■■□ 26
PABPC4Q13310 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.332e-6■■■■□ 26
PABPC4Q13310 BRI3-203ENST00000473967 819 ntTSL 517.89■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 26
PABPC4Q13310 BRI3-206ENST00000491463 567 ntTSL 412.94□□□□□ -0.342e-6■■■■□ 26
PABPC4Q13310 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.342e-7■■■■□ 26
PABPC4Q13310 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.392e-7■■■■□ 26
PABPC4Q13310 MYL6-204ENST00000546630 544 ntTSL 1 (best)17.39■□□□□ 0.376e-23■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 AL031727.1-201ENST00000457263 455 ntBASIC10.97□□□□□ -0.652e-10■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.144e-16■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 RCN1-207ENST00000531345 2653 ntTSL 28.12□□□□□ -1.114e-16■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 RCN1-211ENST00000533898 2416 ntTSL 24.74□□□□□ -1.654e-16■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 RCN1-204ENST00000528630 549 ntTSL 33.53□□□□□ -1.844e-16■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 UQCRC1-209ENST00000480561 1014 ntTSL 217.71■□□□□ 0.432e-7■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 CEBPZOS-202ENST00000397064 568 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.593e-12■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 CEBPZOS-201ENST00000392061 695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.653e-12■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 CEBPZOS-204ENST00000402297 3158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.863e-12■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.523e-12■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 GLRX5-203ENST00000557731 1863 ntTSL 516.24■□□□□ 0.191e-9■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.14e-9■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 GALNT7-204ENST00000505308 1658 ntTSL 28.67□□□□□ -1.024e-9■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 GALNT7-207ENST00000515862 3569 ntTSL 25.36□□□□□ -1.554e-9■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.23e-6■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 AP002807.1-201ENST00000529934 326 ntTSL 58.11□□□□□ -1.113e-6■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.678e-9■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 RPL7A-209ENST00000496554 947 ntTSL 221.78■■□□□ 1.087e-67■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.097e-67■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 RPL7A-204ENST00000463740 1164 ntTSL 57.94□□□□□ -1.147e-67■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.357e-8■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.42e-7■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 NOSIP-212ENST00000599537 833 ntTSL 518.37■□□□□ 0.532e-22■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 NOSIP-206ENST00000598296 529 ntTSL 316.32■□□□□ 0.22e-22■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 NOSIP-203ENST00000594932 602 ntTSL 515.72■□□□□ 0.112e-22■■■■□ 25.9
PABPC4Q13310 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.618e-39■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.528e-39■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 MPP1-208ENST00000439370 2066 ntTSL 514.22□□□□□ -0.138e-39■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 MPP1-213ENST00000482757 989 ntTSL 210.45□□□□□ -0.748e-39■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 MPP1-216ENST00000491955 2378 ntTSL 27.05□□□□□ -1.288e-39■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 RTCB-201ENST00000216038 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.586e-7■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.241e-8■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -01e-8■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 AES-206ENST00000586742 1666 ntTSL 322.19■■□□□ 1.141e-9■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.057e-7■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 PFDN5-210ENST00000550513 939 ntTSL 313.32□□□□□ -0.281e-11■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.123e-7■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.893e-7■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 TMEM109-203ENST00000540280 724 ntTSL 313.57□□□□□ -0.243e-7■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 UROS-207ENST00000464267 1038 ntTSL 316.23■□□□□ 0.194e-7■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.369e-7■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 SIVA1-205ENST00000553819 856 ntTSL 321.57■■□□□ 1.049e-7■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.789e-7■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 SIVA1-208ENST00000556431 4142 ntTSL 212.58□□□□□ -0.49e-7■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.043e-15■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-11■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 AL365226.2-201ENST00000418403 397 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.767e-16■■■■□ 25.8
PABPC4Q13310 PVT1-213ENST00000522414 654 ntTSL 29.74□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 PVT1-222ENST00000613916 137 nt8.24□□□□□ -1.092e-6■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)24.79■■□□□ 1.561e-6■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.451e-6■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.393e-7■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 TMEM258-202ENST00000535042 921 ntTSL 315.43■□□□□ 0.061e-19■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.332e-77■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-77■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 ASH2L-203ENST00000517496 2194 ntTSL 214.71□□□□□ -0.052e-77■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 ASH2L-206ENST00000520079 2119 ntTSL 213.01□□□□□ -0.332e-77■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 ASH2L-208ENST00000521808 613 ntTSL 512.81□□□□□ -0.362e-77■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 ASH2L-207ENST00000521652 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.62e-77■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 ASH2L-202ENST00000428278 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.652e-77■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 SPCS3-203ENST00000507678 2655 ntTSL 224.41■■□□□ 1.54e-11■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.627e-7■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.334e-7■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 RFK-206ENST00000490113 2386 ntTSL 210.47□□□□□ -0.734e-7■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.092e-12■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.42e-12■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.688e-17■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.747e-18■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.517e-18■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.333e-6■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.393e-6■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 CLTB-207ENST00000510734 1489 ntTSL 226.69■■□□□ 1.864e-7■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 CLTB-203ENST00000502877 552 ntTSL 225.08■■□□□ 1.614e-7■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.894e-7■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.64e-7■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.554e-7■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.44e-7■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.224e-7■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.14e-7■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 MRPL55-221ENST00000430433 864 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.224e-7■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 MRPL55-203ENST00000336520 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.224e-7■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 MRPL55-204ENST00000348259 661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.524e-7■■■■□ 25.7
PABPC4Q13310 MRPL55-216ENST00000366744 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.614e-7■■■■□ 25.7
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