Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA4Q13156 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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