Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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