Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD300CQ08708 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms