Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN1BQ07699 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms