Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP4Q07065 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms