Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EXOSC10Q01780 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms