Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms