Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP5P82980 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP5P82980 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP5P82980 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP5P82980 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP5P82980 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP5P82980 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP5P82980 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP5P82980 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP5P82980 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP5P82980 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP5P82980 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP5P82980 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP5P82980 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP5P82980 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP5P82980 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP5P82980 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP5P82980 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP5P82980 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP5P82980 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP5P82980 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP5P82980 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP5P82980 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBP5P82980 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBP5P82980 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RBP5P82980 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBP5P82980 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP5P82980 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP5P82980 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP5P82980 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP5P82980 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP5P82980 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP5P82980 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP5P82980 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP5P82980 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP5P82980 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP5P82980 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP5P82980 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP5P82980 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP5P82980 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP5P82980 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP5P82980 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP5P82980 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP5P82980 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP5P82980 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP5P82980 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP5P82980 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP5P82980 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP5P82980 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP5P82980 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP5P82980 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP5P82980 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP5P82980 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP5P82980 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP5P82980 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP5P82980 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP5P82980 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP5P82980 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP5P82980 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP5P82980 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP5P82980 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP5P82980 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP5P82980 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP5P82980 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms