Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms