Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms