Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms