Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACADSBP45954 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms